L’Ente si impegna da anni in progetti internazionali nell'ambito di molteplici programmazioni europee, Interreg Italia-Francia ALCOTRA, PSR e LIFE, come beneficiario, partner o attuatore di azioni specifiche.

L’Ente vanta una consolidata esperienza di cooperazione transfrontaliera e transnazionale che ha permesso di valorizzare, anche in senso economico, le risorse del territorio e della sua esperienza in materia di ricerca sulla biodiversità, anche grazie alla collaborazione con il Parc National du Mercantour, gemellato con il Parco naturale delle Alpi Marittime dal 1987.